《实验动物科学》创刊于1984年，曾用名《北京实验动物科学》、《北京实验动物科学与管理》、《实验动物科学与管理》等，1988后由北京实验动物学学会、北京实验动物研究中心及北京实验动物管理办公室共同主办至今。为扩大其影响及适应市场经济新形势，1994年起至今，先后与湖北、湖南、内蒙古、山西、河北、天津等省市实验动物相关管理和科研部门以及首都医科大学、中国农业大学、原中国药品生物制品检定所、军事医学科学院、中国人民解放军总医院等高校和科研院所共同合办。《实验动物科学与管理》经国家科委及北京市新闻出版局批准，于1991年开始公开发行（国内统一刊号：CN11-2839/Q，国际统一刊号：ISSN1006-6179，邮发代号：18-131），1994年获准广告经营许可。2007年开个更名为《实验动物科学》，并由季刊改为双月刊。
《实验动物科学》1998年加入《中国学术期刊（光盘版）》，1999年加入“中国期刊网”，随后被“中国学术期刊全文光盘及数据库来源期刊”、“中文科技资料目录－医药卫生”、中国实验动物信息网数据库、“万方数据－数字化期刊”、中国核心期刊（遴选）数据库、中国生物学文献数据库和“中国生物学文摘”等多家数据库收录。2005年我刊被中国科学技术信息研究所的“中国科技期刊统计源（核心）期刊”收录。荣获北京市科技期刊单项优秀奖（96）、北京市新闻出版局编校质量排名第八名（97）。
《实验动物科学》主要面向实验动物及相关领域的科研、管理及技术人员，所载栏目主要有研究报告、设施管理、综述进展、技术方法以及3R专栏等栏目，曾及时宣传报道北京市实验动物管理的有关法规、条例，还先后编辑、出版《医药卫生实验研究中最佳实验动物模型的选择总则》、《第六届免疫缺陷动物实验国际讨论会》等11期专辑。
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